Le site de la cathédrale, sur la colline du Château de Nice, a été le fruit de plusieurs campagnes de fouilles du XIXe s. jusqu'à nos jours. Depuis 2015, les fouilles se sont concentrées sur l’espace funéraire et ont apporté un lot d’informations non négligeables sur l’évolution des pratiques funéraires à la période médiévale ainsi que sur les aménagements extérieurs à l’édifice religieux.